2019年，区党工委、管委会聚焦国企全面深化改革，对全区行政事业单位经营性国有资产和县属企业国有资产作出集中统一监管的重要决策部署。平潭综合实验区国有资产运营管理有限公司（简称“区国资公司”）在国有资产管理体制改革大潮中因时而生。2019年8月21日，国资公司注册成立，注册资本金1亿元。

作为区属一级大型国有企业，区国资公司秉持“一个目标（打造具有平潭特色、现代一流的国有资产运营管理公司）、两个使命（守护资产和创造价值），三个任务（国有资产保值增值、国有资源优化配置、国有资本提质增效），四个阶段（资源归集、资产管理、资金融通和资本运营）”的发展理念，明确“资产运营管理、人力资源服务、产业园区开发运营”主业，兼顾“城市供应链管理和股权投资管理”的职责。自成立以来，区国资公司将自身成长融入国家与实验区发展战略之中，切实担负起平潭国有企业的经济责任、政治责任和社会责任，助推实验区“一岛两窗三区”建设。